Der Bahnhof Emden Aussenhafen liegt fast 2 Kilomter vom Bahnhof Emden Hauptbahnhof entfernt. Direkt gegenüber des Bahnhofs ist der Anlager der Borkum - Fähren. Daher werden einige IC und RE von Emdenhauptbahnhof nach Emden Aussenhafen weitergeleitet. Auch Güterverkehr wird noch in größerem Umfang abgewickelt. Währen der Bahnsteig hochmodern ist, sind Sicherungstechnik und Gleisanlagen recht betagt.