Если отчет отправлялся прямо из программы и бухгалтер получил уведомление об отправке в контролирующий орган. То разобраться почему не был получен отчет должны в контролирующем органе. Если из-за технической ошибки отчет не был доставлен, то отвечает 1С. Если бухгалтер не правильно ввел данные по своему контролирующему органу и отчет отправился не туда, то это ошибка бухгалтера.