A Catedral Basílica de São Salvador é a quarta igreja do Colégio Real da Companhia de Jesus, construída em pedra e cal, cuja pedra fundamental foi lançada em 1657 e a sua construção realizada ao longo de 15 anos.
Sua ornamentação interna (com altares em talha dourada) foi gradativa, até o momento da expulsão da Companhia de Jesus do universo português, em 1759. Embora tenha sido construída durante o período barroco, a arquitetura da catedral é uma expressão do estilo maneirista no Brasil.
Após a expulsão, o conjunto arquitetônico ficou abandonado, até que entre 1766-1767 houve a transferência do cabido da diocese para a antiga igreja dos jesuítas em virtude de obras que estavam sendo realizadas na antiga igreja da Sé. Desde então a antiga igreja do Colégio passou a ser a Catedral Metropolitana.
Em janeiro de 1923, um "breve" do Papa Pio XI eleva a Catedral à categoria de Basílica. Posteriormente, em 25 de outubro de 1980, um Decreto da Sagrada Congregação dos Bispos reconhece a Arquidiocese de São Salvador da Bahia como "Sede Primacial" e seu Arcebispo "Primaz do Brasil".