La cicuta contiene un alcaloide alifático (cicutoxina), que tiene un efecto convulsivógeno sobre el sistema nervioso central y al menos ocho alcaloides piperidínicos tóxicos y teratogénicos, entre los que se encuentran los más potentes llamados coniína y gama-coniceína. Están presentes en las semillas, el tallo, los frutos y las flores. La coniína se halla en un 2% en los frutos y en un 0,5% en las hojas y tiene un efecto similar al del curare sobre la unión neuromuscular. En líneas generales podemos decir que las plantas jóvenes son comparativamente más tóxicas que las plantas maduras. El consumo de 6-8 gramos de hojas puede provocar el fallecimiento de un adulto en pocas horas.