En el histórico campo de Buenavista debutó el Elche en Primera División ante el Real Oviedo con empate a un gol, siendo Pahuet el primer goleador del Elche en la máxima categoría. En el segundo encuentro de liga, Altabix iba a estrenar como campo de Primera División ante el todopoderoso F.C. Barcelona de los Luis Suárez, Ramallets, Evaristo y compañía. El conjunto catalán tuvo el honor de ser el primero de una larga lista de equipos que sucumbieron en el feudo ilicitano. Con goles de Pahuet y Cardona venció el Elche 2-1.
En su primera temporada en la categoría de oro el Elche finalizó en una meritoria décima posición y consiguió estar entre los cuatro mejores equipos de España, llegando a las semifinales de la Copa. Con la competición a punto de finalizar anunció César su marcha del club. Con un Altabix totalmente entregado despidió la afición al héroe de los ascensos, al culpable junto a Esquitino, de que un equipo de pueblo se codeara con los grandes del fútbol español.
En verano de 1960 se disputó la primera edición del trofeo Festa d´Elx, con un triangular entre el Levante, el Hércules y el propio Elche. El equipo valenciano fue el primer vencedor del torneo veraniego ilicitano, al imponerse a Elche y Hércules. En el encuentro restante, los franjiverdes vencieron en el derbi provincial por 4-0. Desde entonces, el Festa d´Elx se ha disputado ininterrumpidamente hasta nuestros días, con la participación de los grandes equipos del fútbol mundial.
La difícil tarea de hacer olvidar a César en el banquillo recayó en su segundo, Miguel Beltral, pero antes de comenzar la liga fue sustituido por Antonio Barrios. A éste no le acompañaron los resultados y el equipo se situó al borde del precipicio y para evitar la caída llegó de nuevo Miguel Beltral, con él se consiguió el mal menor promocionar por la permanencia. El Elche se jugó a doble partido la permanencia ante el Ceuta, en la ida perdió 1-0 en tierras ceutíes, pero en el partido de vuelta consiguió levantar la eliminatoria al vencer por un contundente 4-0. Otro año más en Primera División.
El propio técnico del Ceuta, Juan Ramón, iba a ser el encargado de dirigir al Elche en la temporada 1961/62. El equipo se mostró muy serio durante todo el campeonato y finalizó en octavo puesto. Altabix fue un auténtico fortín, sólo dos grandes como el Atlético de Madrid y Barcelona lograron llevarse los dos puntos; equipos como Zaragoza, Osasuna, Español, Tenerife o Real Sociedad salieron goleados de la ciudad de las palmeras.
Si dos años atrás César había dejado el club, en junio de 1962 José Esquitino Sempere anunció su marcha de la entidad. Los dos pilares básicos de la proeza estaban fuera del Elche, pero Esquitino supo dejar un sustituto a la altura de las circunstancias, Manuel Martínez Valero. Hablar de los buenos tiempos del Elche es hacerlo de Esquitino y Martínez Valero, sus mandatos fueron sinónimo de éxito.
En la temporada 1962/63 no consigue el Elche seguir con la racha de la campaña anterior y los malos resultados provocan la destitución de Juan Ramón. Con el brasileño Pedro Otto Bumbel en el banquillo se reforzó el Elche fichando a Ramos, Pellejero y Forneris. Al final del campeonato se terminó en octava posición, también ocho fueron los tantos que endosaron al Sevilla, la mayor goleada en la historia del club en Primera División.
En la Copa, el Elche estuvo a un paso de protagonizar la hazaña de eliminar al F.C. Barcelona. En el partido de ida en Altabix los franjiverdes muy superiores vencieron 4-1, pero en la vuelta disputada en la ciudad condal el arbitró condicionó el partido con la expulsión de Cardona, que permitió a los azulgranas igualar la eliminatoria. En el encuentro de desempate el Elche acusó el cansancio y perdió por dos goles a uno.