Il Palazzo Farnese (o Villa Farnese) a Caprarola (Viterbo) è considerato uno dei migliori esempi di dimora rinascimentale. Costruito dalla potente famiglia Farnese, il palazzo fu una delle molte dimore signorili costruite dai Farnese nei propri domini. Inizialmente doveva avere caratteristiche difensive come era comune nelle dimore signorili del territorio laziale tra XV e XVI secolo, il cui progetto rtificata venne inizialmente affidato ad Antonio da Sangallo il Giovane dal cardinale Alessandro Farnese il Vecchio. I lavori iniziarono nel 1530, ma furono sospesi con l’elezione al soglio pontificio del cardinale (Paolo III).
Il cardinale Alessandro il Giovane, insediatosi a sua volta a Caprarola, ne riprese l’edificazione affidando il progetto di completamento a Jacopo Barozzo da Vignola, che modificò radicalmente il progetto originale riavviando i lavori nel 1559. Pur mantenendo la pianta pentagonale dell'originaria fortificazione, la fabbrica venne trasformata in una imponente residenza per il cardinale e la sua corte. I bastioni angolari vennero interrotti al primo livello e trasformati in ampie terrazze aperte sulla campagna circostante, mentre al centro della residenza fu realizzato un cortile circolare a due piani, con i livelli superiori arretrati per non interferire con l’armonia del disegno del cortile.
Il Vignola fece tagliare la collina con scalinate in modo da isolare il palazzo e, allo stesso tempo, integrarlo armoniosamente col territorio circostante; inoltre fu aperta una strada rettilinea nel centro del paesino sottostante, così da collegare visivamente il palazzo alla cittadina ed esaltarne la posizione dominante su tutto l'abitato.
All'interno della sontuosa dimora lavorarono i migliori pittori e architetti dell’epoca. I temi degli affreschi furono ispirati dal letterato Annibal Caro e dai dotti umanisti della corte del cardinale, come Onofrio Panvinio e da Fulvio Orsini. Realizzati da Taddeo Zuccari, alla cui morte successe il fratello Federico, poi sostituito da Jacopo Zanguidi, detto il Bertoja. Alle ultime sale lavorarono poi il toscano Giovnni de’ Vecchi e Raffaellino da Reggio.
Alla villa sono annessi gli "Orti farnesiani" (con lo stesso nome dei giardini della famiglia sul colle Palatino a Roma), uno splendido esempio di giardino tardo-rinascimentale, realizzato attraverso un sistema di terrazzamenti alle spalle della villa, arroccati sul colle dal quale s'erge la costruzione e collegati dal Vignola con la residenza attraverso dei ponti. I lavori per il giardino furono iniziati nel 1565 da Giacomo Del Duca, utilizzando per i terrazzamenti la terra di scarico delle fondazioni della chiesa del Gesù a Roma, e si conclusero solo nel 1630, sotto la direzione di Girolamo Rainaldi. La piccola costruzione che si trova all'interno dei giardini è stata scelta da Luigi Einaudi come residenza estiva nel settennio della sua Presidenza della Repubblica (1948-1955). Il palazzo invece fu terminato due anni dopo la morte del Vignola.
Palazzo Farnese è dal luglio 2015 in consegna alla Direzione Regionale Musei Lazio, l’istituto del MiC incaricato di gestire trentantadue tra musei e luoghi di cultura della regione.