La ciudad de Guanajuato alberga uno de los museos más impresionantes, dedicado a los eventos realizado a partir del siglo XVI durante el Medievo, esto es "La Santa Inquisición", un organismo creado inicialmente con el nombre de Inquisición medieval en año de 1184 D.C. en la zona de Languedoc (al sur de Francia) dedicado a la supresión de la herejía en el seno de la Iglesia Católica.

Su origen ideológico se remonta desde el siglo IV cuando los emperadores romanos convierten el cristianismo en religión estatal, con lo cual los herejes o personas de distintas ideologías a las estipuladas por la iglesia son considerados enemigos del Estado.

Debido al papa Inocencio IV en la bula Ad extirpanda expuesta en 1252, los acusados pueden ser torturados como medio legítimo para obtener la confesión de los herejes, esta bula fue confirmada posteriormente por el papa Alejandro IV el 30 de Noviembre de 1259 y por el Papa Clemente IV el 3 de noviembre de 1265. Así mismo esta bula concedía al Estado e Iglesia una parte de los bienes confiscados de acusados encontrados culpables.