Após Itachi desativar o Edo Tensei, Madara Uchiha consegue se libertar da técnica, permanecendo no campo de batalha como um corpo imortal, sem limite de chakra. Enquanto isso, Naruto, Killer Bee, Kakashi e Gai enfrentam Tobi. Utilizando a inteligência estratégica de Kakashi, a equipe coordena seus esforços em uma luta intensa e finalmente consegue quebrar a máscara do inimigo. Para a surpresa de todos, especialmente de Kakashi, descobrem que Tobi é na verdade Obito Uchiha, antigo companheiro de Kakashi, que todos acreditavam estar morto.