През 1936 година в Министерството на войната е създадена комисия, която да открие гроба на Левски. Работи се усилено. Събрани са показания на свидетели на обесването и сваляно от бесилото на тялото на Левски, възоснова на тях се прави обосновано предположение къде е положено тялото на Апостола. При разкопки на трудови войски са намерени скелет и две черепа. За единия от черепите има свидетелски показания, че е на Бенковски, чиято глава, освен че е била разнасяна като трофей, набучена на кол по села и по паланки, е била и веществено доказателство по време на съдебния процес срещу въстаници от Априлското въстание.
Има показания, че черепът на Бенковски е положен в гроба на Левски. За това, че това е вероятният гроб на Левски и Бенковски, има доклади. Полковник Куюмджиев дори предлага да се огради вероятният гроб на Левски и да се направи възпоменателен знак. Особена помощ при издирването на гроба на Левски оказва еврейската общност в България. Костите са предадени в Анатомическия институт на Медицинския факултет, после започва войната и дирите им се губят. Някои твърдят, че са унищожени по време на бомбардировките, разказа историкът и писател Николай Иванов в предаването "Операция: История" по Bulgaria ON AIR.