¿Quieres ver cómo se ensambla un genoma bacteriano secuenciado con Illumina?
Рет қаралды 4,642
3 жыл бұрынLos resultados que vemos de los análisis genómicos suelen concentrarse las capas finales de anotación y comparación, pocas veces podemos ver el "tras de bambalinas" de la fase de ensamble e interacción con los reads. En este video verán en primera fila cómo se ensambla en pocos minutos el genoma de una bacteria secuenciada con tecnología Illumina de reads cortos de 100 bases.
@annycamargo3534 3 жыл бұрын
Muchas gracias por compartirnos su conocimiento y estos fabulosos videos. Realmente son de gran ayuda.!!
@percytullumevergara2823 3 жыл бұрын
Excelente Profesor Alzate, todo muy bien explicado.
@1p53gen Жыл бұрын
¡Qué buen canal! Me suscribo. Gracias por la información.
@DAVIDDC17 3 жыл бұрын
Sumamente interesante
@flodalila314 3 жыл бұрын
Muy bueno!
@christianbustamante23 3 жыл бұрын
Muy buena informacion, Gracias
@osvaldocouoh1838 2 жыл бұрын
Fabuloso, gracias por el video
@andressantiagolozadamenese1762 Жыл бұрын
Excelente video!
@franciscos.9237 Жыл бұрын
Dios, que buen video. Muchas gracias por darte el tiempo de explicarnos. Excelente !!!!!
@genomicafacil8501 Жыл бұрын
Gracias Francisco! Me hace muy feliz que te sea util.
@PaolaRodriguez-cw2qb 3 жыл бұрын
¡Está muy interesante el video! Me emocioné y empecé a seguirle el paso, pero no tengo lumix :c
@nefase2490 3 жыл бұрын
Un gran saludo. Por favor seria muy interesante que hiciera un video que describa cual es el procedimiento para subir un genoma bacteriano a NCBI. El tipo de archivos que se requieren para incluir las secuencias, de acuerdo a la informacion que se tenga, si el genoma solo esta ensamblado o con anotaciones. Gracias
@genomicafacil8501 3 жыл бұрын
Muy buena idea. Lo pondré en la lista para próximos temas. Gracias!
@joeltorres2158 Ай бұрын
Hola! Excelente video, queda bastante claro y resumido. Tengo una consulta ¿Cómo realizo el análisis estadístico? El script se corre bajo python u algún software en específico (?)
@genomicafacil8501 Ай бұрын
Hola Joel. Gracias por el interes y el comentario. Toda la gráfica y estadísticas la hago en R. Me sirve de inspiración el R Gallery. Si te gusta más python, puedes hacer las mismas gráficas y analisis con librerías cómo matplotlib o numpy.
@joeltorres2158 4 күн бұрын
@@genomicafacil8501 ¡Muchas gracias!
@tanyarecaldechiluiza4069 2 жыл бұрын
Hola....por si acaso haz instalado y manejado SIGNAL? tengo unos inconvenientes en su corrida
@genomicafacil8501 2 жыл бұрын
Hola Tanya. Nada, no lo he usado.
@elizabethsolorzano2784 3 жыл бұрын
Excelente explicación, muchas gracias!! solo tengo una duda, instale sratoolkit en biolinux en una vbox, cuando intento ejecutar el comando prefetch me indica que el comando (zsh: command not found: prefetch), pero reviso y esta instalado, y comandos como fastq-dump si funcionan, alguna idea de que puedo estar haciendo mal?
@genomicafacil8501 3 жыл бұрын
Hola Elizabeth. No tengo experiencia con Vbox pero creo que debes dar la ruta absoluta a la carpeta con el programa prefetch
@leuven1470 3 жыл бұрын
Muy buen video estimado profesor. Emplea algùn servidor especifico para hacer el esamblaje? Gracias
@genomicafacil8501 3 жыл бұрын
Yo instalo localmente los ensambladores. Creo que así es más fácil
@leuven1470 3 жыл бұрын
@@genomicafacil8501 muchas gracias
Bioinformatics Coach
Рет қаралды 27 М.
KOMPUKTER
Рет қаралды 245 М.
Reboort_uzb
Рет қаралды 761 М.