น้ำ เป็นสิ่งที่สำคัญที่สุดในการเลี้ยงปลา นอกจากกุ้ง หอย ปู ปลา แล้วในน้ำยังมีสิ่งมีชีวิตตัวเล็กๆ ที่เราเรียกรวมๆ ว่าจุรินทรีย์ด้วย แบ็คทีเรียดีในตู้ปลาของเราเป็นจุรินทรีย์ที่มีประโยชน์ช่วยในการย่อยสลายขี้ปลาและของเสีย ช่วยให้น้ำใส ช่วยกำจัดแอมโมเนีย ไนไตร ไนเตรท ช่วยให้เกิดวัฏจักรไนโตรเจน (Nitrogen Cycle) ที่สมบูรณ์ ช่วยให้ระบบนิเวสก์ในตู้สมบูรณ์แบบ
เราต้องใช้น้ำสะอาดในการเลี้ยงปลา ไม่ทำให้น้ำสกปรก ไม่ใส่สิ่งแปลกปลอมลงไปในน้ำ ไม่ใส่สารเคมีใดๆ ลงไปในน้ำ เพราะว่าจะส่งผลกระทบกับสิ่งมีชีวิตและจุรินทรีย์ที่อยู่ในน้ำ เช่น แอลกอฮอล์ คาร์บอนน้ำ ยากำจัดตะไคร่ เกลือ ด่างทับทิม ยารักษาโรคปลา ยาฆ่าเชื้อ ยากำจัดแบ็คทีเรีย ไฮโดรเจนเปอร์อ็อกไซด์ ไฮเตอร์ เป็นต้น
การเปลี่ยนน้ำตู้ปลาเป็นเรื่องที่สำคัญมาก สำหรับตู้ปลาสวยงามที่เลี้ยงปลาหลากหลายชนิด เลี้ยงปลาจำนวนมากและตู้ปลาที่ให้อาหารปลาเยอะหรือให้อาหารปลาบ่อย เพราะว่าการเลี้ยงปลาด้วยวิธีดังกล่าวจะส่งผลเสียต่อน้ำโดยตรงอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้
ปริมาณน้ำที่ต้องเปลี่ยนจะมากหรือน้อยขึ้นอยู่กับจำนวนปลาและการให้อาหารปลา ปลามากเปลี่ยนมาก ให้อาหารปลามากก็ต้องเปลี่ยนมาก เพื่อช่วยลดน้ำเสียสะสมที่อยู่ในน้ำ
ความถี่ในการเปลี่ยนน้ำ ถ้าเลี้ยงปลาปกติต้องเปลี่ยนทุกสัปดาห์ สัปดาห์ละครั้ง สม่ำเสมอ ทั้งนี้ทั้งนั้นก็ขึ้นอยู่กับจำนวนปลาและการให้อาหารปลาเช่นกัน