Die britische Archäologin Lara Croft hat während der Ereignisse in Tomb Raider die Erfahrung machen müssen, dass Mythen, an die sie bisher nicht geglaubt hatte, wahr sein können und beschäftigt sich daher nun intensiv mit den Forschungen ihres Vaters, Lord Richard Croft. Dieser hatte mit seiner fast wahnhaften Suche nach der Göttlichen Quelle, einem angeblich Unsterblichkeit verleihenden Artefakt, seine Reputation als Archäologe verloren und deshalb vermeintlich Selbstmord begangen, als Lara noch ein Kind war. In London erzählt sie Ana, der ehemaligen Lebensgefährtin ihres Vaters, von ihren neuen Entdeckungen und macht sich anschließend auf den Weg in das vom Bürgerkrieg zerrüttete Syrien. Auf den Spuren eines mittelalterlichen Propheten aus Konstantinopel trifft sie in dessen Grabmal auf bewaffnete Mitglieder des Ordens von Trinity, der bereits zu Zeiten des Propheten existierte und damals versucht hat, ihn und seine Anhänger auszulöschen. Die Truppe wird von einem Mann namens Konstantin angeführt und sucht ebenfalls nach der Göttlichen Quelle, die sich im Besitz des Propheten befunden haben soll, dessen Sarg sich jedoch als leer herausstellt. Lara löst die von Trinity gelegten Sprengsätze aus und kann im entstehenden Chaos fliehen. Anhand eines im Grab gefundenen Zeichens, das ebenfalls in einem Buch ihres Vaters über die verlorene Stadt Kitesch auftaucht, die sich in Sibirien befunden haben soll, zieht sie die Schlussfolgerung, dass das Artefakt sich dort befinden könnte. Einem Agenten von Trinity gelingt jedoch der Diebstahl des Buches aus dem Croft-Anwesen und so entsteht ein Wettlauf zwischen Lara und Trinity um die Göttliche Quelle.