Окончив школу, Саййидмухаммад пошел по стопам родителей: отца - доцента кафедры психиатрии Дагмедакадемии и матери - медработника. В I975-м году в шестнадцатилетнем возрасте он по своей личной инициативе поступил в медицинский институт, на факультет стоматологии. Окончив мединститут, в I980-м году три года проработал в Горагорске,(ЧИАССР), по возвращении - в одной из поликлиник Махачкалы, затем занимался частной практикой. Саййидмухаммад в совершенстве владел своей специальностью, изобрел и пользовался личными методами малой ортопедии, которыми обычно не пользовались в медицинской практике.
"В конце I99I года духовенство пригласило меня на работу, и с тех пор мой стоматологический кабинет закрыт. Раньше лечил зубы, а теперь - общество",- говорил Саййидмухаммад в одном из своих интервью. В I995-м году, будучи работником ДУМД, Саййидмухаммад-хаджи поехал в Сирию на трехмесячные курсы повышения квалификации имамов, где во всемирно известном Дамасском Исламском университете "Абу-Нур" продолжил духовную учебу....
С начала 90-х годов Саййидмухаммад начал принимать активное участие в духовной жизни Республики, организовывал различные мероприятия, на митингах представлял интересы мусульман. В I993-м году работал в ДУМД заместителем Муфтия. После, в I994-м году, по возвращении с курсов повышения квалификации имамов Дамасского университета "Абу-Нур", ему вновь пришлось взяться за ту же работу. В I995- м году Совет Алимов поручил ему курировать вопросы взаимодействия Духовного Управления со средствами массовой информации.
А I-го июля I996-го года руководством Совета Алимов Саййидмухаммад-хаджи Абубакаров был назначен исполняющим обязанности Муфтия на время отпуска Али-хаджи Алиева. С первых же дней своего назначения он активно включился в работу Духовного Управления и особо активизировал деятельность его структур.
На состоявшемся 26 августа I996 года расширенном заседании Совета Алимов Дагестана работе и.о. Муфтия Саййидмухаммада-хаджи Абубакарова была дана высокая оценка. На заседании присутствовало более 60-ти представителей духовенства из городов и большинства районов Дагестана, среди которых был и председатель Совета алимов Дагестана, ректор Исламского института им. Сайфуллы Кади (г. Буйнакск) Арсланали Афанди Гамзатов.