How to Use the NCBI’s Bioinformatics Tools and Databases

  Рет қаралды 60,579

Science Buddies

Science Buddies

Күн бұрын

This video tutorial provides a quick overview of the NCBI website. We walk you through how to search for nucleotide and protein sequences using NCBI’s databases and explain what information is provided with each sequence. We also give you tips on how to interpret gene data and guide you through the process of assessing gene variants and mutations using NCBI’s Variation Viewer. With the information provided in this video, you should be well equipped to start your own bioinformatics or genomics adventure!
If you want to analyze a nucleotide or protein sequence using NCBI’s BLAST tool, you can watch Science Buddies’ BLAST tutorial here: • How to Use BLAST for F...
Science Buddies also hosts a library of instructions for over 1,500 other hands-on science projects, lesson plans, and fun activities for K-12 parents, students, and teachers! Visit us at www.sciencebuddies.org?from=KZfaq to learn more.
#STEM #sciencebuddies #NCBI #bioinformatics
-----------------Contents of this video--------------------
00:00 - What is NCBI?
00:52 - Introducing the NCBI main website
01:20 - Searching for a nucleotide sequence
05:03 - Searching for a protein sequence
06:41 - Reviewing the gene record page
08:05 - Assessing gene variants with the Variation Viewer
*******************************
Connect with Science Buddies:
TWITTER: / sciencebuddies
FACEBOOK: / sciencebuddies
INSTAGRAM: / scibuddy
PINTEREST: / sciencebuddies

Пікірлер: 16
@R_HeavyBones
@R_HeavyBones 2 жыл бұрын
Finally a video with nice narration. The scheduling of the video is very good, great explanation with nice pace. Someone had to say thanks :D
@islamalmsarrhad2152
@islamalmsarrhad2152 9 ай бұрын
Many thanks, such a comprehensive and accurate video
@khouloudchentouh7282
@khouloudchentouh7282 Жыл бұрын
thanks for the quality work
@bhavikapawar1999
@bhavikapawar1999 10 ай бұрын
Very well explained,thank you so much
@giovanniforcari4970
@giovanniforcari4970 2 жыл бұрын
Loved that 😍
@yvetteghannam4683
@yvetteghannam4683 11 ай бұрын
well done!!
@sihembouhouya2998
@sihembouhouya2998 7 ай бұрын
Thanks, this video helped me a lot
@Justdoit20196
@Justdoit20196 6 ай бұрын
أكبر ألم تعيشه عندما يساء فهم تصرفاتك مقال الثلاثاء د. جاسم المطوع يوسف عليه السلام دخل السجن ظلما على الرغم من أنه كان مع امرأة العزيز في غرفة مغلقة لوحدهم، فمن ينظر للمشهد من بعيد يقول مستحيل أنه لم يحصل شيء بينهما، ولكن الحقيقة أنه بريء، والسيدة عائشة رضي الله عنها دخلت المدينة متأخرة عن القافلة وكانت مع صفوان بن أميه، فمن يرى المشهد يقول لا شك أن بينهما شيء وهذا ما استغله المنافقون بترويج الإشاعة عنهما، وظلت السيدة عائشة رضي الله عنها متألمة شهرا كاملا بسبب نظرة الناس وتفسيرهم الخاطئ تجاهه فعلها، وكذلك يوسف عليه السلام ظل متألما سبع سنوات داخل السجن وكل من في القصر يتحدث عنه، إن يوسف عليه السلام تربى في مدرسة والده وتعلم منه ما قاله عند مصيبته (إنما أشكوا بثي وحزني إلى الله وأعلم من الله ما لا تعلمون) والسيدة عائشة رضي الله عنها تربت في مدرسة محمد صلى الله عليه وسلم والمدرسة اليوسفية وكانت تردد نفس قول يعقوب عليه السلام (إنما أشكوا بثي وحزني إلي الله وأعلم من الله مالا تعلمون)، وقد برأها الله تعالى من سابع سماء وأنزل فيها آيات تقرأ إلى قيام الساعة، كما برأ يوسف عليه السلام أمام مشهد الملأ مثل هذه القصص في القرآن والسيرة لم تذكر عبثا، وإنما ذكرت ليتعلم منها الإنسان أنه لا يحكم على أفعال الآخرين فقط، ولا يحلل ما يشاهده من غير معرفة نوايا الآخر ومقصده، فهذه القاعدة الصحيحة في التعامل الإنساني مع الأصدقاء والأهل والأحباب، بل وحتى مع الأعداء، كما حصل لإسامة بن زيد رضي الله عنه لما بعثه رسول الله مع رجل من الأنصال لموضع عند قبيلة جهينة فلحقا رجل لقتله فلما وصل إليه قال الرجل : لا إله إلا الله ، فتوقف الأنصاري عن قتله ولكن أسامة قتله، فلما رجع للمدينة عاتبه رسول الله على فعلته، فقال أسامة : يا رسول الله إنما قالها خوفا من السلاح، فقال له رسول الله كلمة صارت قاعدة في العلاقات الاجتماعية والإنسانية وهي : (أشققت عن قلبه حتى تعلم أقالها أم لا؟) أقتلته بعدما قال لا إله إلا الله ؟ قال أسامة : فما زال يكررها علي حتى تمنّيتُ أني لم أكن أسلمتُ قبل ذلك اليوم ! فالإنسان يمر بمواقف كثيرة بحياته يحكم على الأشياء من ظاهرها، وفي كثير من الإحيان يسيء الفهم او التحليل بحكم بشريته، ولا يعنى هذا لا يوجد في الحياة مخادعون أو كذابون، ولكننا إذا أردنا أن نحكم على تصرف إنسان وحتى يكون الحكم صحيحا علينا أن ننظر إلي سيرته وعمله وكلامه، ولا نحكم على العمل فقط، لأن كل انسان ممكن أن يرتكب خطأ ولكن ننظر لحسناته وسيئاته وحينها نقرر حدود العلاقة معه، فإن كانت حسناته كثيرة فهي تشفع لسيئاته (إن الحسنات يذهبن السيئات)، وهذه القاعدة لولاها لما صارت العلاقات الإنسانية اليوم والصداقات ولعل السؤال المهم هو : لماذا ظن السوء يكون دائما هو الطاغي في العلاقات ؟ والجواب لأن ظن السوء مصدره الشيطان، وابليس أهم هدف عنده بحياته افساد العلاقات، سواء كانت العلاقة مع الله أو بين الزوجين أو بين الأحباب والأصدقاء، ومهم جدا عندما يساء فهمك أن تطلب الحديث مع من أساء فهمك لتوضح طريقة تفكيرك ووجهة نظرك وكيف تنظر للحدث، فأكثر المواقف يكون لها أكثر من تفسير، مثل موقف يوسف عليه السلام وموقف السيدة عائشة رضي الله عنها، وقصة أسامة فهذه تعلمنا أصول العلاقات والصداقات، أما في حالة لو شعرت بالظلم من تفسيرات الآخرين تجاهك فردد (حسبي الله ونعم الوكيل) فتكون قد فوضت أمرك لله، أو لو كان من المقربين وممن أحببتهم فقل (اللهم إني ظلمت فاشرح صدر من ظلمني حتى يرى الحقيقة)
@DB-kv3wu
@DB-kv3wu 9 ай бұрын
Best and accurate tutorial especially for bignners.
@user-ct9qv8ry9d
@user-ct9qv8ry9d 4 ай бұрын
Thank you so much ❤❤❤❤❤❤love
@W5nli
@W5nli 2 ай бұрын
How do threshold cycle?
@himanshuchauhan4962
@himanshuchauhan4962 6 ай бұрын
Mam i have a problem 1st is I have no idea to chek the protein structure though tha blast so mam you teach me
@durdonamalikova577
@durdonamalikova577 10 ай бұрын
@saranawzad7019
@saranawzad7019 19 күн бұрын
😊
@user-ti2uv7hb7g
@user-ti2uv7hb7g 4 ай бұрын
07:42
@Umaymerve
@Umaymerve 9 ай бұрын
thank u, it helps a lot.
How To Create Real-Time PCR Primers Using Primer-BLAST
12:26
Steven Bradburn
Рет қаралды 136 М.
Western Blot  Method - Animated  Video
11:46
Biology with Animations
Рет қаралды 111 М.
ЧУТЬ НЕ УТОНУЛ #shorts
00:27
Паша Осадчий
Рет қаралды 8 МЛН
Clowns abuse children#Short #Officer Rabbit #angel
00:51
兔子警官
Рет қаралды 73 МЛН
Does size matter? BEACH EDITION
00:32
Mini Katana
Рет қаралды 20 МЛН
How Genes Express Themselves: Crash Course Biology #36
11:38
CrashCourse
Рет қаралды 46 М.
Comparing DNA Sequences
10:00
Bozeman Science
Рет қаралды 219 М.
NCBI Gene Database - Overview
5:47
StrGznCat
Рет қаралды 38 М.
The beauty of data visualization - David McCandless
18:18
TED-Ed
Рет қаралды 1,4 МЛН
Malaria Microscopy - A Step by Step Guide
14:33
MCD Global Health
Рет қаралды 227 М.
Primer designing for real time PCR using NCBI Primer Blast
9:41
Bio-Resource
Рет қаралды 158 М.
Bioinformatics Databases, Software, and Tools
14:13
Clinical Biochemistry by Dr. P. K. Prabhakar
Рет қаралды 3,1 М.
Data Modeling for Power BI [Full Course] 📊
2:34:41
Pragmatic Works
Рет қаралды 3,2 МЛН