Bien que l'ancien joueur de l'OL ait pris en compte ces intérêts, il a tout de suite été clair pour lui que le Napoli était sa priorité. Un choix osé pour certains mais assumé par le joueur, totalement emballé par le projet. Mais il fallait également l'accord de Tottenham et de son président Daniel Levy, réputé pour être aussi dur en affaires que le patron napolitain Aurelio De Laurentiis. Durant de longues semaines, les différentes parties ont donc traité. Pendant ce temps-là, Ndombele s'est préparé individuellement, lui qui avait été mis de côté par Antonio Conte durant la préparation estivale des Spurs.
Deux mois durant, le joueur, qui a vécu tant bien que mal cette mise à l'écart, a donc travaillé d'arrache-pied pour être le plus opérationnel possible lorsqu'on ferait appel à lui. La bonne nouvelle est arrivée le 19 août. Ce jour-là, Naples et Tottenham ont trouvé un accord pour un prêt avec option d'achat de 30 millions d'euros. Heureux, Ndombele avait chaleureusement été accueilli par les Tifosi sur le sol italien avant de passer avec succès la traditionnelle visite médicale. Après quelques coups de crayon pour signer les documents officiels, l'aventure de Ndombele à Naples pouvait enfin commencer.