O Menino e o Mestre conta a linda história de Michael, que junto com sua família se aventura em uma viagem de barco ao redor do mundo. Em meio a uma tempestade, Michael e sua cachorrinha Stella acabam caindo no mar e são levados pela correnteza para uma ilha remota no Pacifico onde enfrentam muitas adversidades na luta pela sobrevivência. Em meio a este cenário Michael conhece um sábio mestre japonês que se apresenta como Kensuke, o único habitante desta ilha paradisíaca, na qual ele construiu seu lar. Uma linda e verdadeira amizade começa a surgir, entre duas pessoas de diferentes idades, e que não falam a mesma língua. Até que um dia a ilha começa a ser ameaçada por caçadores de animais que desejam destruir o mundo frágil e maravilhoso que Kensuke criou na ilha. Eles vão precisar de toda coragem e habilidade para salvar este lindo reino.