Understanding Gene Coverage and Read Depth

  Рет қаралды 24,585

MedGenome

MedGenome

4 жыл бұрын

Gene Coverage and Read Depth are important parameters that determine the accuracy of the report. This video explains the concept in an illustrative manner using a case example
#genetictestingindia #MedGenome #NGS #Sequencing

Пікірлер: 12
@MallikaVenkatramani
@MallikaVenkatramani 4 ай бұрын
As a genetic counselor in-training - I really appreciate this! Thank you!
@abumohammed9659
@abumohammed9659 Жыл бұрын
Thank you so much I was not sure about genome coverage before I see this amazing video !!!!!!
@sabaiqbal8873
@sabaiqbal8873 Жыл бұрын
Excellent Sir. keep posting such a shot videos for easy understanding plz
@ZiggyMercury
@ZiggyMercury 4 жыл бұрын
Great video, thanks! One small correction: at 3:12 you say: "when I sequence a sample at 100X depth, and if the tumor [mutation] content is around 20%, at least 200 fragments will show up a mutation". I think it should be "20 fragments" and not "200 fragments", no?
@Kabirr
@Kabirr 3 жыл бұрын
yeah you make sense
@noureddineIDALI
@noureddineIDALI 2 жыл бұрын
yeah thats true
@aartihansda8352
@aartihansda8352 3 жыл бұрын
Thank you for the video.
@AnkushSharma-zv5hv
@AnkushSharma-zv5hv 2 жыл бұрын
thanks for easy explanation
@aang7505
@aang7505 3 жыл бұрын
thank you very much!
@shreyaverma1699
@shreyaverma1699 Жыл бұрын
Thank you
@MrRamaeri
@MrRamaeri 2 жыл бұрын
Thank you so much, 🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇🥇
@N5033
@N5033 Жыл бұрын
Best ever
ЧУТЬ НЕ УТОНУЛ #shorts
00:27
Паша Осадчий
Рет қаралды 9 МЛН
CNV analysis with Daniel Howrigan
20:04
Psychiatric Genomics Consortium
Рет қаралды 2,5 М.
How to find the best sampling depth for rarefaction (CC202)
22:23
Riffomonas Project
Рет қаралды 4 М.
Next Generation Sequencing 1: Overview - Eric Chow (UCSF)
31:26
iBiology Techniques
Рет қаралды 456 М.
What is sequencing depth? | Bioinformatics 101
7:53
Bioinformagician
Рет қаралды 12 М.
The Fundamentals of Genome Assembly
30:56
Bioinformatics DotCa
Рет қаралды 7 М.
Finding Somatic Mutations in Cancer Genome Sequence Data
1:50:01
Bioinformatics DotCa
Рет қаралды 3,9 М.
Introduction to RNA-Seq for Researchers
31:11
Iowa Institute of Human Genetics
Рет қаралды 95 М.
Sanger DNA Sequencing, From Then to Now.
14:37
ClevaLab
Рет қаралды 47 М.
Ноутбук за 20\40\60 тысяч рублей
42:36
Ремонтяш
Рет қаралды 268 М.
Смартфон УЛУЧШАЕТ ЗРЕНИЕ!?
0:41
ÉЖИ АКСЁНОВ
Рет қаралды 1,2 МЛН
Как удвоить напряжение? #электроника #умножитель
1:00
Hi Dev! – Электроника
Рет қаралды 1 МЛН