Рождение свыше равнозначно спасению. И за спасение пришлось заплатить смертью Христа - чтобы искупить наши грехи, омыть нас Своей кровью - чтобы мы были приняты в Божью семью. Это и есть рождение свыше. Первый раз мы родились в этот мир и были потомками Адама, а второй раз - родились свыше от Бога при принятии спасения. Чтобы спасение стало возможным, Иисусу пришлось принять смерть на кресте и воскреснуть. До этого - не было спасённых людей, потому что Иисус еще не купил нам вход в Царство. Помните, Он говорил, что меньший в Царстве Божьем больше всех пророков Ветхого Завета? Они предрекали Новый Завет, новое рождение, крещение Духом, но сами в этом не жили. Воскрешение Иисуса начало для нас время Нового Завета - ведь именно Его кровь и скрепила этот завет. Поэтому до воскресения Христа и не было рожденых свыше, как и спасенных. А молитва Иисуса, которую вы привели в качестве примера, как раз и говорит о том, что Иисус посвятил Себя ради нас, чтобы мы были едины с Богом, и грех, которых раньше лежал пропастью между людьми и Господом, был смыт кровью Христа, и мы могли быть рождены свыше, чтобы Его Дух мог жить внутри нас.