巨神兵動畫裡有兩個效果 代價都是犧牲兩隻怪獸 一個是無限大攻擊 另一個是直接給對手4000傷害

巨神兵在動漫中有兩項能力，第一項為攻擊力上升至無限大後可攻擊任意數量的怪獸，海馬VS決鬥機器(或決鬥電腦)中對付3隻青眼白龍(漫畫版)及青眼究極龍(動畫版)，還有暗遊戲VS暗馬利克中對付翼神龍都用此項能力；第二項只出現在動畫版，為破壞對手場上所有怪獸並直接給予對手4000點傷害(好像巨神兵清空殲滅對手場上怪獸後做直接攻擊)，暗遊戲＆海馬VS兩位古魯斯獵人(海外版該兩位獵人就是未戴面具的光暗假面二人組)，還有暗遊戲VS海馬中天空龍VS巨神兵都用過此項能力。但巨神兵用該項能力時攻擊力未提升至無限大仍維持在4000點，只能破壞攻守能力在4000以下的怪獸(視該怪獸攻守狀態決定)，所以當時海馬VS暗遊戲中控制巨神兵發動第二項能力對付攻擊力達6000的天空龍時沒有將其破壞，又被暗遊戲捨棄手牌中的栗子球躲過4000點的直接傷害。 之後巨神兵的第二項能力經過改良，變成攻擊力先提升至無限大，破壞掉對手場上所有怪獸(不管對手場上怪獸攻守能力值多大)，之後攻擊力恢復原本4000點，再直接攻擊對手給予4000點傷害。因此巨神兵改良後的第二項能力為破壞對手場上所有怪獸(不論對手場上怪獸的攻守能力值多大)，並給予對手4000點傷害。電影版光之金字塔中，巨神兵就是用改良版第二項能力擊破攻擊力提升到9000的青眼究極龍以及攻擊力提升到35000的斯芬克斯 • 安德魯吉尼斯。實卡"靈魂能量MAX!!"也是套用巨神兵的改良版第二項能力，且是陷阱卡，能夠還原巨神兵也能在對手回合發動能力的設定。