En septembre 1999 (millésime 2000) interviennent les modifications qui vont changer radicalement l'avant de la Saxo. Les anciens projecteurs rectangulaires qui rappelaient ceux de l'AX sont abandonnés au profit de nouveaux en forme d'amande, que l'on redécouvrira quelques mois plus tard avec une dimension différente sur la Xsara phase 2. Le capot intègre désormais deux nervures longitudinales ainsi qu'une nouvelle calandre. Les ailes sont modifiées en conséquence. La partie inférieure des feux arrière adopte un rouge plus clair. La version diesel est dotée d'un moteur 1.5 de 58 ch qui consomme peu pour l'époque 5 L/100 km en moyenne. Une version de base essence 1.0 de 50 ch jusqu'en 2000 est aussi au catalogue. Très dépouillée (pas de moquette, allume-cigare, vitres teintées et vitres arrière entrouvrables sur 3 portes), elle est moins homogène que les autres modèles de la gamme équipés des moteurs 1.1, 1.4 et 1.6. La version sportive (VTS 16S) développe une puissance de 120 ch. Il existe plus exactement une finition typée sportive nommée VTS, cette version étant disponible en 3 motorisations essence : 1.4 8 soupapes de 75 ch ; 1.6 8 soupapes de 90 ch passé à 100 ch à partir du 1er janvier 2001 ; 1.6 16 soupapes de 120 ch ; et une motorisation diesel réservée au marché belge ; 1.5D 58 ch. La 1.1i existe, en option (1 500 €), en motorisation bicarburation essence-GPL. Quant à la boite automatique, elle est proposée en option d'abord sur les versions VSX 1.6 8 soupapes puis en option sur les versions 1.4. En 2000, l'usine de Mangualde cesse de fabriquer la Saxo. L'ensemble de la production est dès lors assuré par le site d'Aulnay-sous-Bois (lequel, comme le site de Mangualde, fabriquait la Saxo depuis 1996). En 2001, Citroën propose sur le marché néerlandais une série spéciale Saxo Asics Summer Edition en partenariat avec l'entreprise éponyme d'équipement sportif. Puis 2002 voit l'apparition de celle qui sonnera le glas de la Saxo : la citadine C3, suivie l'année suivante par la C2. En juin 2003 la fabrication de la Saxo est arrêtée et la voiture est vendue jusqu'à épuisement des stocks.

La Citroën Saxo est un modèle d'automobile du segment B produit par le constructeur automobile français Citroën de 1996 à 2003. Elle est programmée pour prendre la relève de la Citroën AX produite de 1986 à 1999. Elle a été produite sur le site d'Aulnay-sous-Bois (Seine-Saint-Denis) et dans l'usine située à Mangualde au Portugal en version 3 et 5 portes. Au Japon, elle était commercialisée sous le nom Citroën Chanson de 1997 à 1999, avant d'adopter l'appellation Saxo comme dans le reste du monde.

Le moteur était-il bien chaud dès le début ?