Выявить Sars-Cov-2 на смартфоне можно в 10 раз дешевле при помощи слюны и набора простых реагентов без покупки ПЦР теста и без похода в лабораторию.
Содержание:
00:00 диагностика ковида методом LAMP
00:18 экспресс ПЦР малоэффективны и дороги
02:04 петлевая изотермическая амплификация
03:31 100% эффективность диагностики
05:00 дешевая диагностика коронавируса
05:44 выводы авторов
06:29 субъективное мнение
Ссылка на исследование:
jamanetwork.com/journals/jama...
Методика уже существует, доступ к ней полностью открыт, есть бесплатное приложение, формулы реактивов для анализа на смартфоне в открытом доступе и могут появиться в продаже уже завтра.
Экстремальные ситуации всегда дают мощный толчок науке. За эту эпидемию вирусология, иммунология, лабораторная диагностика ощутимо подросли. Довольно дорогие и недостаточно точные экспресс ПЦР тесты давно вызывали вполне оправданное раздражение у врачей и пациентов. Эффективность на уровне 40-60% энтузиазма не вызывают, а цены на них остаются кусачими.
Между тем, понимать, ковид у вас или обычное ОРВИ довольно полезно, хотя бы в контексте заботы о пожилых родственниках и людях с ослабленным иммунитетом. Симптомы уже не помогают - у последних вариантов они плавают в довольно широком диапазоне.
Другими словами - нужен простой, быстрый и недорогой тест на ковид, желательно массовый и дешевый. Такой тест уже разработан.
Профессор Майкл Махан из Калифорнийского университета предложил дешевый и эффективный метод для верификации ковида, использующий слюну, копеечные реактивы и обычный смартфон.
В основе метод петлевой изотермической амплификации (LAMP), ранее широко обсуждавшийся научным сообществом в контексте ковида
Например тут:
virusjour.elpub.ru/jour/artic...
Хочу подчеркнуть, что идея с дешевыми тестами и смартфоном намного шире ковидной тематики - представьте, какие перспективы она открывает во фтизиатрии (т.е. можно быстро определить открытую форму туберкулеза у наблюдаемых), пульмонологии (быстро подобрать антибиотик, к которому чувствителен возбудитель) или, например, в дерматологии.
Например, после появления рези в уретре, Вы уже не бежите лабораторию, чисто теоретически связанную с алчным дерматологом, а спокойно и приватно покупаете реактивы, включаете приложение и получаете результат. Охватить всю палитру возбудителей с помощью LAMP не выйдет, но основные и значимые инфекции - вполне реально.
Как это работает в предложенном варианте
Анализируется слюна. Приложение и лабораторный набор используют камеру смартфона для оценки химической реакции и постановки диагноза за 25 минут. Реагенты содержат флуоресцентный краситель, который светится, когда вирус амплифицируется - чем больше вируса, тем больше светится. Такие тесты стоят в 10 раз дешевле даже экспресс ПЦР теста.
Это при том, что эффективность их приближается к 100%, в отличие от экспресс ПЦР.
Посмотрите результаты исследования:
Среди 50 участников, ранее не инфицированных SARS-CoV-2, включенных в исследование, 29 были мужчинами.
SmaRT-LAMP продемонстрировал 100% соответствие (50 из 50 образцов пациентов) критерию стандартной диагностики CDC для чувствительности к SARS-CoV-2 (20 из 20 положительных и 30 из 30 отрицательных) и для количественного определения вирусной нагрузки.
Кроме того, эта платформа также соответствовала стандарту критерия CDC для обнаружения клинически сходных вирусов гриппа A и B в образцах слюны с добавлением (n = 20) и в образцах слюны госпитализированных пациентов (50 из 50 отрицательных). Анализ LAMP на смартфоне был быстрым (25 минут), чувствительным (1000 копий/мл), недорогим (менее 2 долларов за тест) и масштабируемым (96 образцов/телефон).
Цитирую авторов
Низкая стоимость технологии и теста позволит проводить широкое тестирование в развивающихся странах. Мы предоставили приложение и технологию с открытым исходным кодом и бесплатно доступны для всех. Приложение Bacticount доступно в Google Play; реакционная смесь и рецепт опубликованы в открытом доступе.
Тест и саму методику можно легко адаптировать для других патогенов с пандемическим потенциалом, включая новые варианты COVID и грипп. Было показано, что SmaRT-LAMP обнаруживает многие патогены, в том числе стафилококки, стрептококки, сальмонеллы, кишечную палочку; и он работает с человеческой кровью, мочой, фекалиями и слюной.
При массовом выпуске тестов авторы уверены, что их стоимость составит всего 2 доллара за тест на COVID и грипп. Тут же они пишут, что ранее демонстрировали, что инфекции мочевыводящих путей можно определять благодаря этой методике вообще за 1 доллар за тест.