Skanery są skalibrowane przez producenta na etapie produkcji, a późniejsza kalibracja dokonywana jest każdorazowo w trakcie czynności serwisowych urządzeń. Jednocześnie istnieje możliwość samodzielnej kalibracji skanera przy użycia transparentnego wzornika IT8.7/1 oraz kompatybilnego programu do kalibracji, np. basICColor. Utworzony profil ICC następnie wczytujemy do programu sterującego skanera, który przydzieli go do każdego pliku na etapie skanowania. Dodatkowo skaner samodzielnie ustawia ostrość w zależności od wymiarów skanowanych obiektów, przy czym dysponujemy również możliwością kalibracji fokusa i balansu bieli (w przypadku materiałów refleksyjnych). Docelowa przestrzeń barwna, w której zapisujemy nasze pliki to AdobeRGB1998, albo do przestrzeni barwnej skanera czyli z profilem ICC producenta skanera lub profilem stworzonym przez nas.