～2XXX年―地球・未来都市メガポリス～
大アンドロメダに向け999号の出発の時が迫っていた。
博物館を訪れていたメーテルと鉄郎の前に突如現れた謎の少女ジュラ。
人類存亡の危機を告げ宇宙に去っていったジュラを999号で追う鉄郎とメーテル。かつて「はやぶさ」が探査した小惑星「イトカワ」でジュラと出会う鉄郎だが、あわてて飛び去ったジュラの小型宇宙船は小惑星に衝突して木星に落下してしまう。果たして鉄郎はジュラを助けることが出来るのか？ジュラの言う人類存亡の危機とは何か？
～太陽系の星々をめぐる999号の時空を超えた冒険物語～